Отладчик dbx (часть Sun Studio) может подключаться к процессу JVM и позволяет вам сделать один шаг между кодом Java и собственным кодом. Функциональность получила кодовое имя "jdbx", хотя все это часть dbx. Это не было сильно продвигается, так что это может иметь ошибки. Были проблемы, когда в среде IDE было два механизма отладки, оба обрабатывали Java, но использование командной строки dbx позволяет избежать этих проблем.
Конечно, есть, вероятно, множество более традиционных способов отладки вашей конкретной проблемы без необходимости использования отладки на уровне исходного кода, которая может смешивать код Java и C.