Ваш EntityManager должен быть введен в сущность до того, как сущность будет построена, что возможно только при использовании AspectJ плетения или статического инициализатора, что было бы ужасным способомделая это.
Если вы имеете в виду удаление с использованием метода экземпляра сущности, то да, вы можете, снова предполагая, что EntityManager доступен этому методу.
Вообще говоря, сущностьне будет сохраняться при создании экземпляра, но другой не обязательно будет нетипичным.