Я знаю, что этот вопрос старый, но вот ответ:
ExcelPackage pck = new ExcelPackage();
ExcelWorksheet ws = pck.Workbook.Worksheets.Add("Example");
string index= "A1";
ws.Cells[index].Style.Fill.PatternType = ExcelFillStyle.Solid;
ws.Cells[index].Style.Fill.BackgroundColor.SetColor(System.Drawing.Color.Orange);
Обратите внимание, что вы должны установить PatternType, прежде чем сможете установить цвет фона или возникнет исключение.
Извините, но мой пример - c #, вам нужно конвертировать в VB.Net, чтобы он был на 100% правильным для вопроса!