Это будет зависеть от того, какой плагин уценки вы используете, есть много из быстрого поиска в Google.
Вам нужно будет либо найти документацию в Интернете для конкретной используемой вами версии, либо, возможно, просмотреть исходный код и, если это необходимо, изменить его с открытым исходным кодом.
Или просто найдите другой, который позволяет эту функциональность.
редактирование:
Кажется, что django использует python-markdown (http://www.freewisdom.org/projects/python-markdown/),, на первый взгляд кажется, что он не поддерживает указание только определенных опций форматирования. Однако это кажется легко расширяемым, поэтому, если вы напишите расширение, вы можете использовать его в django, например так: :
{{ string|markdown:"extension_name,extension2,etc..." }}