когда вы изменяете имя пакета на Refactor, но в R-файле имя пакета не будет, поэтому android market учитывает имя пакета R-файла.
Измените имя пакета в файле AndroidManifest.xml, теперь имя пакета R будет автоматически изменено. Теперь измените старое имя пакета src на новое. Удостоверьтесь, что деятельность - правильное отображение.