Я думаю, что для того, что вы хотите сделать, вам нужно создать две колонки TableLayoutPanel, а затем внутри каждой колонки создать дополнительную TableLayoutPanel. На стороне, которую вы хотите разрешить прокрутку, установите AllowScroll = true для ее sub-TableLayoutPanel, а на стороне, которую вы не хотите прокручивать, установите AllowScroll = false для ее sub-TableLayoutPanel.