В вашем коде с
new Properties().load(...)
, конечно, но из командной строки doc говорит только о ключе = val
Имейте в виду, что есть некоторые ключи(например, java.library.path), который должен быть установлен перед запуском вашей программы и сброс в вашем коде не будет иметь никакого эффекта.