Для Python 2 (см. Другие ответы для Python 3) попробуйте:
execfile('file.py')
Пример использования:
C:\junk>copy con execfile_example.py
a = [9, 42, 888]
b = len(a)
^Z
1 file(s) copied.
C:\junk>\python27\python
Python 2.7.1 (r271:86832, Nov 27 2010, 18:30:46) [MSC v.1500 32 bit (Intel)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> execfile('execfile_example.py')
>>> a
[9, 42, 888]
>>> b
3
>>>