Причина, по которой бегун MS Test не распознает тестовые проекты, заключается в том, что ему нужен тип тестового проекта в файле .csproj. Первоначально он был создан как проект класса для NUnit, а не как проект MsTest. Это необходимо добавить в файл .csproj:
<ProjectTypeGuids>{3AC096D0-A1C2-E12C-1390-A8335801FDAB};{FAE04EC0-301F-11D3-BF4B-00C04F79EFBC}</ProjectTypeGuids>