просто как:
Preference preference = (Preference) findPreference("pref");
PreferenceScreen preferenceScreen = (PreferenceScreen) findPreference("pref_screen");
PreferenceCategory preferenceCategory = (PreferenceCategory) findPreference("pref_category");
Чтобы скрыть предпочтение:
PreferenceGroup preferenceParent = getParent(preference);
preferenceParent.removePreference(preference);
Чтобы скрыть экран настроек:
PreferenceGroup preferenceScreenParent = getParent(preferenceScreen);
preferenceScreenParent.removePreference(preferenceScreen);
Чтобы скрыть категорию предпочтений:
PreferenceGroup preferenceCategoryParent = getParent(preferenceCategory);
preferenceCategoryParent.removePreference(preferenceCategory);
То же самое происходит с EditTextPreference, CheckBoxPreference, .....