«Java-команды» (какими бы они ни были) обычно не вводятся в командной строке.Вы можете попробовать простой grep, но:
# grep 'my.super.cool.Stuff' *.jar
Теоретически нужно избегать точек, чтобы они не соответствовали любому символу, но это, как правило, дает представление о том, где находится класс.