Оригинальный ответ остается в силе и не зависит от времени. JRuby - это просто версия Ruby, которая работает на виртуальной машине Java (JVM). Если вы начинаете с нуля, просто выберите Ruby. JRuby в основном полезен для людей, которые имеют существующий код Java и хотели бы, чтобы их приложения JRuby и Java взаимодействовали.