Откройте свойства проекта в проекте Flash Builder. Затем выберите Flex Compiler.
Найдите флажок «Копировать не встроенные файлы в выходную папку». Убедитесь, что это проверено. Если нет, компилятор не будет перемещать не встроенные изображения в ваши папки bin-debug [или bin-release].