Под "изменением" файла я понимаю, что вы имеете в виду его редактирование или что-то в этом роде.
Нет, это не ошибка.Большинство текстовых редакторов записывают содержимое измененного файла в другой файл, затем сбрасывают и закрывают его, затем удаляют оригинал и переименовывают другой файл в оригинал.
С другой стороны, некоторые «простые» операции редактированияНапример, добавление строки в файл с помощью echo whatever >>thefile
не приведет к удалению файла, но откроет / ищет / пишет / очищает / закрывает его.