Из коробки SqlMembershipProvider
действительно не работает так.Он предназначен для поиска очень специфических хранимых процедур и схемы, которая сопровождает их. Вы не можете действительно "вставить" в нее другую схему и ожидать, что она будет работать.
При этом реализация пользовательского поставщика членства на самом деле не так уж и сложна.Я делал это много раз, и вам не нужно все реализовывать.
Документы MSDN - хорошее место для начала, и они проведут вас через все, что требуется.