Я не знаю автоматизированного способа сделать это, но это не должно быть слишком сложно. Если бы это было мое, я бы просто отправил свой SQL Server или Oracle DDL в тестовую базу данных Derby и начал бы искать ошибки.
Затем я бы начал писать короткую программу на своем любимом языке сценариев для обработки DDL и замены частей, на которые жалуется Дерби, на синтаксис, который требует Дерби.