Когда вы добавляете элемент управления в форму, если элемент управления запрашивает использование DLL, он не будет обращаться к ссылкам в вашем проекте. Дизайнер заглянет в GAC, чтобы найти требуемую dll.
Если проектировщик не может найти нужный файл в GAC, он выдает ошибку, которую вы упомянули.
Зарегистрируйте необходимые библиотеки DLL в GAC, чтобы разработчик VS IDE мог получить к ним доступ.