Если это ошибка, которую вы получаете, я думаю, что ваши данные загружаются в R просто отлично, но у R есть ограничение на количество строк данных, которые они будут выводить на консоль.Что имеет смысл - вы, вероятно, не хотите просеивать полмиллиона строк на текстовом терминале.
Вы можете проверить фактический размер вашего объекта с помощью функции dim (), чтобы увидеть, сколько строкR думает, что есть.