Если в вашем решении есть несколько платформ, на которые вы хотите настроить таргетинг, можно определить несколько конфигураций для встраивания в файл tfsbuild.proj:
<ItemGroup>
<ConfigurationToBuild Include="$(BuildFlavour)|Any CPU">
<FlavorToBuild>$(BuildFlavour)</FlavorToBuild>
<PlatformToBuild>Any CPU</PlatformToBuild>
</ConfigurationToBuild>
<ConfigurationToBuild Include="$(BuildFlavour)|x86">
<FlavorToBuild>$(BuildFlavour)</FlavorToBuild>
<PlatformToBuild>x86</PlatformToBuild>
</ConfigurationToBuild>
</ItemGroup>
MSBuild и TFSBuild будут создавать любые проекты, которые соответствуют любой конфигурации.