Это больше вопрос о сбое сервера.
Но реального влияния нет, кроме того, какое дисковое пространство используется. Когда виртуальная машина приостановлена, текущее состояние записывается на диск. После этого виртуальная машина - это просто еще один каталог с файлами в нем.