Entity Framework (все версии) поддерживает CUD (вставка, обновление, удаление), но не поддерживает пакетные команды. Это означает, что каждая вставка, обновление и удаление выполняются в отдельном цикле передачи в базу данных.
Это не имеет отношения к WCF. Если вы хотите пакетировать через WCF, вам просто нужно отправить коллекцию объектов для обработки и позволить им обрабатывать на сервере EF (без пакетирования). Службы данных WCF поддерживают пакетную обработку для передачи нескольких объектов на сервер за одну передачу туда и обратно.