Во время моих нескольких поисков в соответствующих руководствах и веб-информации я наконец понял это.
Каталог сайта Emacs, в котором находится пакет плагинов, это /etc/emacs/site-start.d.
Переменная 'jde-jdk-registry', установленная в 'customize-variable', отсутствует, потому что вы не загрузили путь lisp пакета jdee в файл инициализации .emacs, который находится в домашнем каталоге cygwin. Ниже приведен мой контент .emacs:
;; Load CEDET
(load-file "/etc/emacs/site-start.d/cedet-1.0/common/cedet.el")
;; Enabling various SEMANTIC minor modes. See semantic/INSTALL for more ideas.
;; Select one of the following.
(semantic-load-enable-code-helpers)
;;; (semantic-load-enable-guady-code-helpers)
;;; (semantic-load-enable-excessive-code-helpers)
;; Set JDEE.
(add-to-list 'load-path (expand-file-name "/etc/emacs/site-start.d/jde/lisp"))
(add-to-list 'load-path (expand-file-name "/etc/emacs/site-start.d/cedet/semantic"))
(add-to-list 'load-path (expand-file-name "/etc/emacs/site-start.d/jdee-2.4.0.1/lisp"))
(add-to-list 'load-path (expand-file-name "/etc/emacs/site-start.d/cedet/speedbar"))
(add-to-list 'load-path (expand-file-name "/etc/emacs/site-start.d/elib"))
(add-to-list 'load-path (expand-file-name "/etc/emacs/site-start.d/cedet/eieio"))
(require 'jde)
(setq jde-check-version-flag nil)