проверить файл file.php на наличие ошибок компиляции.
php file.php
, находясь в этой папке, протестируйте используемый скрипт
perl scriptname.pl
, чтобы отображалась ошибка std (вместо общей ошибки 500, которую вы видите при запуске скриптачерез CGI).