Плагины не должны настраивать ведение журнала. ведение журнала обычно настраивается напрямую с помощью twistd из командной строки --logfile. Не стесняйтесь отправлять сообщения журнала в ваш плагин обычным способом как twisted.python.log.msg()
Помните, что twistd - это удобство, оно не предназначено для того, чтобы быть началом и концом всех ваших потребностей в витом приложении. Если вам действительно нужно что-то более изощренное, чем может предложить twistd, то вполне нормально создать экземпляры плагинов и запустить реактор самостоятельно.