Я тоже работаю с конфигурацией GWT-Spring, и у меня никогда не было подобных проблем. Это ваше решение использовать один файл или другие файлы конфигурации. Возможно, у вашего друга есть проблема с конфигурацией, или он использует более старую версию зависимости Spring, где сканирование компонентов не работает.
Я не думаю, что это имеет какое-либо отношение к тому, как вы обнаруживаете свои бобы Spring.