Какой продукт вы используете для установки программного обеспечения? Такие продукты, как InstallShield, теперь часто включают шаги SQL в качестве опции для вашего сценария установки.
В противном случае вы можете использовать isql / osql для запуска скрипта из командной строки через командный файл.
Один из разработчиков, с которыми я сейчас консультируюсь, написал довольно изящный установщик SQL. Я спрошу его, когда он войдет, как он это сделал.