Я предлагаю перенести классы сущностей в отдельную сборку. Это не только решит вашу проблему, но и является правильным решением с точки зрения дизайна.
Кроме того, вы можете преобразовать свой веб-сайт в веб-приложение.
[Update]
Если вы не можете разделить сущности на отдельную сборку, и если преобразование в веб-приложение невозможно, вы можете попробовать извлечь скомпилированную dll с веб-сайта.
Когда ваш сайт будет построен, DLL будет находиться по следующему пути (зависит от вашей платформы):
C:\Windows\Microsoft.NET\Framework\v4.0.30319\Temporary ASP.NET Files\website1