Вы запускаете monkeyrunner со своего компьютера разработчика с подключенным устройством или работающим эмулятором.
Как:
$ monkeyrunner myscript.mr
Если вы используете Linux или OS X, вы можете использовать she-bang, включая это в качестве первой строки в скрипте
#! /usr/bin/env monkeyrunner
при условии, что monkeyrunner находится в вашем PATH.