Если это Guid со значением NULL, вы можете проверить, имеет ли оно значение:
if (entity.MyGuid.HasValue)
{
// hooray!
}
Если оно не имеет значения NULL, проверьте значение по умолчанию или пустой GUID:
if (entity.MyGuid != default(Guid))
{
// hooray!
}
if (entity.MyGuid != Guid.Empty)
{
// hooray!
}