было бы неплохо обновить обе панели обновлений при нажатии на одну из них?
тогда вы должны использовать триггеры:
<asp:UpdatePanel ID="updatePnl" runat="server" UpdateMode="Conditional">
<ContentTemplate>
//your html
</ContentTemplate>
<Triggers>
<asp:AsyncPostBackTrigger ControlID="updatePnl_SECOND" />
</Triggers>
</asp:UpdatePanel>
<asp:UpdatePanel ID="updatePnl_SECOND" runat="server" UpdateMode="Conditional">
<ContentTemplate>
//your html
</ContentTemplate>
</asp:UpdatePanel>
В случае выше, если пользователь щелкает что-то, что отправляет обратно из updatePnl_SECOND, updatePnl также будет обновляться.
Это тебе помогает?