Я должен был установить следующее в файле buildAgent.properties
system.FxCopRoot = c: \\ Program Files (x86) \\ Microsoft FxCop 1.36
Обязательно избегайте ободочной и обратной косой черты.
Затем мне пришлось создать артефакт из конфигурации компиляции в папке bin, содержащей сборки, которые я хотел видеть в FxCop. Затем мне пришлось создать зависимость артефакта от этого артефакта в конфигурации сборки FxCop; в противном случае не было бы доступных сборок для FxCop tp.
Это помогло мне.