Нет, Xcode не перекомпилирует нетронутые файлы - за исключением случаев, когда вы выполняете «очистку» или вносите изменения в один из включенных файлов. В любом случае, если ваши файлы не слишком большие - это не проблема. PS У меня был проект с более чем 300k строк в XCode, и файлы с 30-40k. Даже этот размер управляем. Так что я бы на самом деле не волновался ...