Нет, потерянное соединение не может этого сделать.Но если происходит сбой MySQL, вы можете получить, что сервер отключен, и сбой может повредить таблицу.
Вам необходимо выяснить, почему происходит сбой MySQL.В худшем случае плохой жесткий диск - надеюсь, у вас хорошие резервные копии.Если нет, сделай это СЕЙЧАС!