как насчет (используя jquery):
предположим, что скрипт на странице содержит функцию 'myfunc', которую вы хотите выполнить.
var script = $( "#webscript" );
(или любой другой способ получить тег сценария, содержащий код)
var myfunc = null; // declare the function-name (perhaps even not necessary)
eval(script.html()); // where myfunc is declared and assigned to your myfunc variable
Теперь попробуйте использовать функцию:
myfunc();
Edit2:
возможно, вы также можете «вставить» код еще раз :
var copyScript = document.createElement('script');
copyScript.type = 'text/javascript';
copyScript.text = script.html();
document.head.appendChild(copyScript);