EventAggregator и Messenger похожи. Они оба используются для отделения связи между различными компонентами, которые используются в составном приложении. в большинстве случаев они оба предлагают сходные функции.
В Messenger есть возможность широковещательной рассылки всем подписчикам или целевым подписчикам, использующим ключ. Я не уверен, существует ли такая функция в EventAggregator.
С точки зрения плюсов и минусов, MVVMLight очень легкий. Призма приходит с другими связанными DLL. Если вы не хотите использовать все функции Prism, вы можете просто использовать EventAggregator.
Хотя я и не использовал ни одну из этих платформ с MEF или Unity, но, поскольку они являются утилитами / помощниками / надстройками, или как вы их называете, они должны работать.