Проверка подлинности прокси была добавлена в NuGet v1.4. Мы строим это для поддержки аутентифицированных репозиториев в NuGet v1.5.
Тем временем вы можете либо ограничить доступ по IP, как предложено в другом ответе. Вы также можете создать обработчик маршрута клиента, который позволит вам создавать «пользовательские» URL-адреса для каждого пользователя, который встраивает свой токен аутентификации. Вот как DevExpress в настоящее время делает это.
Подробнее см. http://nuget.codeplex.com/discussions/258457.