В Process Explorer я вижу, что IIS загружает собственные версии некоторых системных DLL вместо обычных управляемых.
Например, я вижу Microsoft.JScript.ni.dll, System.Data.ni.dll, mscorlib.ni.dll и еще пару.
Никто не запускал ngen на этом сервере.
Это Windows 2008 R2.
Что может быть причиной этого?