Это действительно зависит от контекста и того, что вы пытаетесь сделать с этими файлами.Мои папки Windows обычно хранят файлы размером менее 4 КБ (4096), потому что при их отображении Explorer имеет тенденцию зависать.
Однако в ОС на базе * nix у меня было 10k + файлов в папке беззаметная потеря производительности, учитывая, что я знал, какие файлы я искал.
Очевидно, что если вы собираетесь выполнять итерацию в папке, что является операцией O (n), это займет больше времени, чем большефайлы у вас есть.