Проверьте параметры Visual Studio. Выберите Сервис -> Параметры -> Visual Studio Team Foundation
Проверьте, выбрана ли у вас Получить последнюю версию товара при оформлении заказа.
Также проверьте Инструменты -> Параметры -> Контроль источника -> Среда
и в разделе «Параметры среды управления исходным кодом» проверьте, выбрано ли «Получить все, когда открыто решение или проект».
Эти два варианта вместе, вероятно, приведут к описанному вами поведению.