Чтобы использовать .Net сборки в SQL Server, необходимо включить интеграцию CLR в SQL Server. В этом разделе MSDN есть несколько хороших примеров.
Поскольку у вас уже есть логика в .Net, не лучше ли было бы делать всю работу там? По мере роста вашего приложения вам будет гораздо лучше хранить всю свою бизнес-логику в коде и использовать базу данных в качестве хранилища данных.