Используйте функцию EXIST, чтобы определить, существует ли конкретная папка.
Функция DIR возвращает структурный массив всех объектов в каталоге. Пустая папка будет содержать только 2 объекта: .
(текущий каталог) и ..
(корневой каталог).
resDir = 'C:\temp\source\';
folder = 'folder1';
folderfull = fullfile(resDir,folder); %# full path to the folder
if exist(folderfull,'dir')
foldercontent = dir(folderfull);
if numel(foldercontent) > 2
%# folder exists and is not empty
end
end