Несколько сотен мегабайт не являются проблемой для пакета ролей для Azure. Существуют ограничения для размеров учетных записей хранилища, в которые должны быть помещены ваши пакеты, если он достаточно большой, около 100 гигабайт. Помимо огромного количества времени, которое потребуется для загрузки пакета и раскрутки нового экземпляра, это должно быть приемлемо.
Для больших двоичных файлов я хотел бы рассмотреть возможность использования учетной записи хранения вместо пакета развертывания. Чем больше пакет развертывания, тем больше времени требуется для запуска нового экземпляра, что уже занимает около 20 минут. Поскольку ссылка указывает на то, что большая часть этой потребности в хранилище предназначена для связанных данных COM, это может быть нелегким вариантом для вас.