Нет, нет внутренней библиотеки шифрования XML, потому что JSR-106 был отозван.Поэтому вы должны использовать внешний API.К сожалению, API-интерфейс Santuario не так чист, как большинство API-интерфейсов, включенных в среду выполнения Java.
http://www.jcp.org/en/jsr/detail?id=106
PS при использовании любой библиотеки шифрования XML, обязательно проверьте содержимое перед расшифровкойили у вас могут возникнуть проблемы, например, с атаками с использованием оракула (это предупреждение содержится в спецификации шифрования XML W3C, но часто игнорируется).