Переменная сеанса в вашем запросе не была правильно проанализирована. Вы можете исправить это, используя синтаксис фигурных скобок:
$query = mysql_query( "select id from CUSTOMER where username = '{$_SESSION[ "username" ]}'" );
или объединить его с помощью оператора точки:
$query = mysql_query ( "select id from CUSTOMER where username = '" . $_SESSION[ "username" ] . "'" );
Вы можете найти больше информации о разборах строк в руководстве по PHP .