Я думаю, что вы путаетесь с 'импортировать проект' с 'импортировать из SVN'.
Если источник для 'проекта Eclipse' извлечен на ваш локальный диск, NetBeans может увидеть его и выполнить svn-действия с ним через окно Избранное.
При импорте проекта Eclipse в NetBeans среда IDE должна создавать различные файлы метаданных, которые описывают ваш проект. Если вы поместите эти новые файлы метаданных в исходное дерево вашего существующего проекта, новые файлы будут отображаться как «новые» файлы в отношении SVN.
Если вы используете Maven для описания своего проекта в Eclipse, вам не нужно «импортировать» проект в NetBeans ... NetBeans понимает maven pom.xml ... вам просто нужно «Файл-> Открыть проект» и укажите путь к каталогу, в котором хранится файл pom.xml ваших проектов.