Вы пытаетесь использовать буфер обмена X для всех копий и вставок?Если это так, хорошая альтернатива xclip - убедиться, что вы используете vim с поддержкой X (очень легко скомпилировать Vim, если у вашей версии его нет), а затем добавьте в vimrc следующее:
set clipboard=unnamed
Все янки и удаляемые затем автоматически попадут в регистр *
(который является регистром выбора X).
Вместо установки clipboard=unnamed
вы также можете использовать регистр выбора X дляодна операция с использованием (например)
"*yw
"*yy
"*ya(
или чего-либо еще.
Очевидно, это не ответит на ваш вопрос о том, как использовать xclip, но, надеюсь, предлагает альтернативный подход.