Сначала вы должны убедиться, что вы загрузили и установили сервер Mysql для их веб-сайта. http://dev.mysql.com/downloads/mysql/. После того, как вы загрузите установку, она попросит вас настроить ее, что я предлагаю вам сделать очень просто и не требует любые модные знания. Тогда сервер позволит вам создать столько баз данных, сколько вы пожелаете.
Как только программа установки завершится, в ваших программных файлах должна быть ссылка на командную строку mysql, введите ваш пароль, и вы войдете в систему с учетной записью root.
show databases;
позволит вам увидеть базы данных по умолчанию. Делайте все, что вам нужно для SQL, создавайте таблицу .... тут же из вашего кода вам нужно скачать библиотеку jar http://dev.mysql.com/downloads/connector/j/, а затем изменить свой код для подключения с помощью драйвера JDBC.
Эта ссылка - очень длинное руководство по использованию jdbc http://www.roseindia.net/jdbc/jdbc-mysql/, которое, похоже, вам и нужно.
Мне лично всегда нравится кодировать себя и избегать попадания в уже созданные фреймворки, так как вы не контролируете все. Фреймворки могут показаться хорошими, но через год, когда появятся новые причудливые требования, они могут просто заставить вас начать все заново, вот мои 2 цента