Если значение в скобках является числовым (и при условии, что предыдущий текст не содержит скобок), вы можете сделать:
$('li a').each(function() {
var replaced = $(this).html().replace(/\(([0-9]+)\)/, "<span>($1)</span>");
$(this).html(replaced);
});
http://jsfiddle.net/LpYMW/1/
Это добавляет интервалвокруг скобок.В примере я выделил диапазон, чтобы вам было легче увидеть эффект.