Да, вы должны обрабатывать пользовательские идентификаторы, используя точный индекс соответствия Neo4j владеет своими идентификаторами и сгенерирует их для вас. Единственный раз, когда вы можете установить их, это когда вы используете BatchInserter, хотя я не думаю, что привязки Python поддерживают его, пока.