Каков наилучший способ передачи данных с внешнего сканера на базу данных на мой сайт я работаю в среде LAMP, веб-сервисы это хорошая идея? гусеничный ход каждые 15 минут.
Это зависит от сканера, но теоретически да, веб-сервисы - лучший вариант. Вам просто нужно проанализировать ответы XML в вашей БД.